Использование видеокарт NVidia Tesla K20X для проведения расчётов в рамках моделирования атомов значительно ускорило процесс получения данных о структуре белковой оболочки вируса.
Определение структуры белковой оболочки вируса ВИЧ было проведено впервые и позволит сделать очередные шаги к созданию эффективных средство против вируса. В рамках исследования, учёные из университета Иллинойса (UIUC) использовали суперкомпьютер Blue Waters оснащённый 3000 графических ускорителей NVidia Tesla K20X. Мощности суперкомпьютера позволили провести атомарное моделирование включающее более 64 миллионов атомов вируса.
Полученные в результате исследования данные помогут создать более действенные лекарства против ВИЧ
Профессор физики Клаус Шультен (Klaus Schulten), руководитель проекта, так описал процесс моделирования:
Без той мощности, которые мы получили благодаря использованию графических ускорителей в системе Blue Waters, мы бы не смогли провести моделирование системы такого масштаба. Переход на использование видеокарт был осуществлен пять лет назад и позволил нам значительно продвинуться в работе.
В самое ближайшее время, учёные планируют ещё больше продвинуться в изучении структуры и поведении белковой оболочки вируса ВИЧ благодаря дальнейшему наращиванию количества графических адаптеров в составе суперкомпьютера.